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生物分子解卷积和报告软件ProMass应用领域

ProMass可用于自动对多种生物分子的多电荷ESI质谱进行去卷积。下面列出了其中一些应用程序实例。


蛋白质类:

肌红蛋白,MW 16951.5 Da

牛血清白蛋白,分子量66430 Da

人转铁蛋白,MW 80kDa

酵母烯醇酶,MW 46671 Da

蛋白质混合物5-30 kDa LC / MS:数据:胰岛素,RNQ酶A,核糖核酸酶B,碳酸酐酶,溶菌酶

混合实例:以上事例中的色谱图作为单个光谱处理

单克隆抗体,人类IgG - 1 Kappa , 150 KDa

人类生长激素,22 KDa

猪和牛血红蛋白的混合物,15-16 KDa


肽类:

糖蛋白胰蛋白酶图谱,来自以来数据的三重播放实验的全扫描肽谱的去卷积

IgG胰蛋白酶图谱,来自以来数据的三重播放实验的全扫描肽谱的去卷积


寡核苷酸:

Poly-T18 LC / MS , 5.5kDa

高通量寡核苷酸QC ,5-14 kDa

20-120 mer寡核苷酸,6-37 kDa


下面详细介绍有关上述事例的更多信息。

高通量寡核苷酸分析量确认:

借助新的摘要页面功能和带有颜色编码的结果指示,ProMass可用于高通量格式分析生物分子。我们已经开发出了使用LC / MS的自动化方法,该方法可以对寡核苷酸进行在线脱盐,从而每隔1分钟可分析一次样品,结果采用颜色编码,使分析人员可以专注于未提供与其结果的样品。

o HT寡核苷酸分析示例显示了96孔样品板视图

o 20mer - 120 mers寡核苷酸


蛋白质分析量测定:

使用我们的捕集/清洗样品分析方案,我们能够通过自动ProMass处理在每个样品中在约3分钟内测定蛋白质分子量。这是使用4种蛋白质标准品肌红蛋白,BSA,酵母烯醇酶和人转铁蛋白的示例。


肽段分析:

ProMass可用于处理太短图谱数据以反卷积光谱并生成报告。它甚至可以用于处理使用依赖于数据的扫描模式(例如,LCQ上的三重播放)获取的数据。ProMass 提取全扫描质谱图,并对这些扫描进行去卷积。这些数据可以作为SEQUEST搜索和缩放扫描数据的不充,因为MS或缩放扫描模式下可能没有获取扫描数据中可能存在次要成分。下面列出一些示例:

来自LCQ三重播放实验的

糖蛋白肽图o来自LCQ三重播放实验的单克隆抗体(IgG)肽图


蛋白质/寡核苷酸LC/ MS分析:

ProMass可以处理蛋白质或寡核苷酸样品中的数据。由于Xcalibur处理方法定义了峰的选择方式,因此您可以定义几乎任一类型的峰选择方案,例如:N个大峰,峰均超过用户定义的相对强度阈值等。可以从质量范围色谱中处理峰,TIC或基峰色谱图。下面列出了一些示例,这些示例显示LC / MS运行中单个大峰的自动处理:

o载脂蛋白-肌红蛋白LCMS

o寡核苷酸分析:Poly-T18LC / MS

o5种蛋白质,胰岛素,核糖核酸的LC/MS分离B,RNA酶A,溶菌酶,碳酸酐酶


单光谱处理:

您还可以使用ProMass对文本文件或Windows剪切板中的单个光谱进行反卷积,此模式对于输液数据分析很有用。除没有色谱图外,还以单光谱模式生成HTML报告。


混合分析:ProMass在整理出的混合物做了很好的工作。例如,我们获取了这种蛋白质混合物的LC / MS色谱图,并对6-13分钟内的光谱求和,以生成ProMass的单个输入光谱。结果显示在这里。如您所见,即时混合物很复杂,ProMass也会拾取LC/ MS数据中存在的组分。


低信噪比光谱的反卷积:

ZNova在处理低信噪比光谱方面有作用。有几个内置功能可以实现此目的。自动去除对于较大蛋白质的不均匀的ESI光谱中观察到的“峰”。应用连续平滑操作的能力提高了数据质量。ZNova评分使人们可以对反卷积结果地进行置信度测量。ZNova具有的灵活性,可以让你自动地识别所需的信息。例如,人们可能指向获得具有高置信度的主要成分。或者,可能感兴趣寻找刚好高于噪声的分量。通过适当设置ZNova参数,一个人可以完成这些目标之一。


单克隆抗体(IgG's)的分析:

ProMass对蛋白等打蛋白很有用。诸如平滑和去除之类的内置功能使您可以获得有关糖型异质性的可靠信息。


应用在:

  • 在粗混合物或纯化开发过程中筛选目标重组蛋白

  • 以高通量和自动化的方式确认合成肽和寡核苷酸的分子量

  • 用于肽图研究(例如,IgG肽图)

  • 用于补充数据库相关性分析

  • 用于杂质分析

  • 用于监视翻译后,化学或机械性药物靶标的修饰

  • 用作协作在线工具,使生物学合作者可以通过公司内部网轻松访问分析数据


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