分子生物学和序列分析工具套件

解锁序列数据的值

Sanger测序分析

  • 简单的序列组装和简单的重叠群编辑,减少分析定位时间

  • 用于基因预测,基序,翻译和编译调用的自动注释

  • 具有自动梯形拟合和峰调用功能的基因型微卫星轨迹,并生成等位素因表

 

 

下一代测序分析

  • 序列视图中显示带注释的基因组和装配体的可视化效果

  • SNP变异分析,您可以选择算法或查看提供的变异调用

  • 统计编程语言R知识可进行简单的RNA-Seq表达分析

 

 

分子生物学

  • 在一个步骤中模拟分子克隆操作,限制,Gateway,Golden Gate和In-Fusion克隆

  • 使用引物工具设计和测试PCR和测序引物,并创建自己的可搜索引物数据库

  • CRISPR工具可快速找到位点,设计指导RNA并分析您的编辑结果

 

 

NGS预处理,组装和制图

  • 使用NGS预处理工具进行下游分析,产生序列数据

  • 映射算法可产生数据结果

  • 从基因组组装和使用比对工具进行比对和整理,处理自测序仪的数据

 

 

比对和系统树

  • 使用MAFFT和Clustal Omega在内的算法对DNA或蛋白质进行成对和多重比对

  • 经过算法(RA×ML和PAUP*)构建系统树,并为发布图形调整显示设置

 

 

NCBI和BLAST

  • 在NCBI上快速搜索关键数据库以获取文献,DNA和蛋白质序列信息,或设置自动搜索

  • BLAST搜索NCBI数据库中的序列,结果直接返回Geneious Prime或建立本地数据库,然后在本地对其进行BLAST

  • 将序列直接提交给GenBank,基因组,引物痕迹等

 

 

 

 

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2021-04-07 15:47
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