GraphPad Prism 10:解锁新潜力

GraphPad Prism是一款统计分析与绘图软件,广泛应用于生命科学研究领域。它提供了直观易用的界面和强大的功能,使得科研人员能够轻松地进行数据分析、绘制高质量的图表和生成统计报告。 

 

GraphPad Prism支持各种统计分析方法,包括均值比较、方差分析、回归分析、生存分析等。用户可以选择合适的统计测试,进行数据的比较和推断,并得出科学结论。同时,软件还提供了多种图表类型,如线图、柱状图、散点图、饼图等,用户可以根据需求自由定制和美化图表,以展示数据的趋势和关系。  

 

此外,GraphPad Prism还具备数据管理和数据导入功能,可以方便地导入外部数据,并对数据进行整理和筛选。软件还提供了多种导出选项,使得用户可以将结果以多种格式保存,包括图片、表格和报告文件。GraphPad Prism 10已发布。

 

强有力的数据分析。高等图形定制。简化协作。

  • 分解数据:引入更开放的文件格式,实现新的工作流程和集成强有力的数据分析。
  • 结果的简化解释:一种新的响应式“要么一个,要么没有”P值汇总风格
  • 更全的分析:双向方差分析的默认多重比较方法
  • 图形检查器:一种新的交互式多变量图形定制方法
  • 扩展的数据功能:更快的性能和对更大数据集的支持
  • 使用新工具包装数据:新函数、新语法、新输出等等
  • 访问更多结果:全新的分析常量对话框
  • 简化协作:使用Prism Cloud测试版发布、共享和讨论您的工作
  • 还有更多!

 

更开放的文件格式

Prism文件包含大量关于您工作的有用信息:从原始数据到您选择的分析选项和后续结果,再到您创建的自定义图形。但归根结底,这都是你的工作。我们相信您应该始终能够访问它。这也是我们选择与prism 10一起发布新的.prosm文件格式的原因之一。”

 

该文件格式使用.prsm文件扩展名,以可访问的行业标准格式(如CSV、PNG和JSON)存储原始数据、分析参数和结果以及自定义图形。

 

通过利用先前实验或分析中收集的数据,您可以促进有效的数据重用,并提高研究的透明度,以便在未来的实验中做出更明智的决定。本着保护互操作性和可重用性的精神,新的文件格式允许您接受FAIR数据原则。

 

我现有的工作怎么样?

 

无论您是刚开始使用Prism还是已经使用了几十年,我们都知道保持对结果的访问是多么重要(毕竟,这就是我们初始选择采用开放格式的原因!)。因此,我们不希望您无法访问您以旧文件格式(扩展名为.pzfx或.pzf)生成的任意Prism文件。这就是我们在Prism 10中引入“兼容性模式”的原因。

 

Prism 10的新功能仅与新的文件格式兼容。当尝试保存为较旧的格式(.pzfx或.pzf)时,Prism将自动检查文件中是否存在任意这些不兼容之处,并在存在任意不兼容之处时向您发出警告。如果没有,文件将按照您的预期保存。

 

一种响应P值汇总方法

 

在Prism 10中,我们引入了一种新的响应P值汇总方法,使全部人都能很容易地解释您的结果。我们新的“一个或无”P值样式如果P值低于用于测试的统计阈值(alpha),则为其指定一个星号,如果大于该阈值,则不指定星号。

 

重要的是,与其他P值汇总方法不同,这一方法将始终考虑所使用的alpha值。无论您使用的alpha是0.05、0.01还是任意其他值,您都能够准确地解释此P值摘要。请记住,您应该始终报告用于分析的alpha级别。就这么简单!

 

为什么这很重要?

 

对于其他P值汇总方法,0.032的P值可能会被指定一个星号(*),导致观众错误地认为它低于所选的0.01的阿尔法阈值。然而,当使用不同的方法时,这种缺乏清晰度的情况变得更加困难。

 

双向方差分析多重比较的新选择

在进行双向方差分析后,通常有兴趣检查多组单独的成对组比较,也称为Prism中的“多重比较”。

 

在Prism 10中,现在可以很容易地执行行和列内的同时比较,从而提供了一种处理多次比较的简化方法。以前,这种比较必须单独进行,这增加了复杂性,并损害了各种比较的校正精度。Prism 10中的这一新功能简化了流程,确保应用适当的校正,同时能够有效分析行和列中的比较。

 

在Prism 10之前,这些比较必须单独进行(一次查看行内的比较,另一次查看列内的比较)。在Prism 10中,我们添加了这种新的多重比较方法作为新的默认选择。

 

用于图形定制和数据探索的新工具

我们为您创建了一种全新的方式来与多变量数据交互并从中自定义图形。新的图形检查器通过在一个位置为多个变量图形组合您喜爱的自定义工具,为数据可视化提供了新的控制级别。此侧面板在与图形交互时始终可用。它提供实时更改和可视化更新,并能够比以前更快、更直观地绘制气泡图。

 

这也为数据探索提供了一种更具触觉的方法,允许您选择单个数据点来高亮显示它并查看其属性(从表中),或者再次单击以高亮显示其在图形上的对应点组。

 

访问的数据比以往任意时候都多

任意一个数据表中可以包含的列数都增加了一倍。现在,您至多可以在2048列中拥有数据(每个列中至多有512个子列)。这是Prism 10中一行中总共超过100万个值:这是Excel工作表中一行的64倍!Prism 10还允许您根据需要打开任意多个窗口,从而取消了仅同时打开16个单独窗口的限制。

 

性能改进的其他领域包括导出大范围的数据、渲染图形、在项目文件中的图纸之间切换、导出图形和布局以及模拟大量数据。

 

访问比以往任意时候都多的结果

分析常量对话框(也称为“Hook常量对话框”)的组织结构得到了极大的改进。现在,结果被组织成一个易于导航的树结构,每个分析都有多个层次的组织,可以很容易地深入到感兴趣的特定值。该树结构与Prism内部用于将计算结果存储在新文件格式中的结构相同,使全部人都可以轻松查看这些值(即使没有Prism!)。

 

“分析常量”对话框现在涵盖了Prism分析的整个库。以前版本的Prism中分析常量对话框中没有的双向方差分析等分析结果现在可以链接。

 

使用所有新工具整理数据

Prism 10为多变量数据表引入了一系列新工具,帮助您的数据做好分析和绘图准备。这包括使用“提取”和“重排”将多变量数据转换为Prism的其他数据表结构时的新选项,以及可用于“选择和变换”分析的新变换。

 

Prism Cloud Beta:协作变得简单

Prism Cloud测试版是一款全新的基于web的应用程序,允许您发布、共享和与同事讨论您在Prism中已经完成的工作。随着Prism 10的发布,Prism Cloud工作区将开始为选定的Prism订阅自动创建。登录Prism Cloud并访问Prism Cloud工作区后,您所要做的就是打开Prism文件,单击Prism Cloud工具栏图标,然后将您的作品发布到Prism Cloud。

 

从那里,您可以与工作区的其他成员共享您的工作,或者邀请其他Prism Cloud用户直接查看您的工作。在查看您的工作时,其他人可以通过在您发布的项目中创建讨论直接为您提供反馈。停止来回发送电子邮件,开始更快地获得您需要的反馈!

 

增强的功能和改进

 

新功能

 

全新的文件格式

创建和自定义多变量图的所有新方法

图形检查器

重新设想格式的图形对话框

无限图形画布

全新的图形引擎,从头开始构建,具有独特的功能

选择以突出显示(组)

实时定制

Prism Cloud集成

更大更快

主要性能改进

增加了数据限制(2048)

更多你所爱的

新的P值样式

双向方差分析后多重比较的改进

新的多重比较方法

选择特定比较

 

数学功能

 

扩展的选择和转换分析功能

 

引入了能够创建分类变量的“IF()”函数。例如IF(A<18,“儿童”,“成人”)

 

增加了标准转换函数:min(变量)、max(变量)和mean(变量)

 

引入了一个连接函数来创建分类变量。例如,如果A=“Smith”和B=“John”,则连接(B,“”,A)=“John-Smith”(注意中间的“”在两个指定值之间引入了一个空格)

 

在使用“变量与值”选择行时添加了“不丢失”选项

 

为其他用户定义函数引入了额外的转换工具(例如,在非线性回归中)

 

“与”和“或”函数的替代形式。以前,Prism会期望形式(X>3 AND X<10)。Prism 10接受等效形式AND(X>3,X<10)

 

使用IF()函数时,可以将null值指定为“”或使用null。例如,如果Y值为空,函数if(Y=“”,5,10)将返回值5。如果Y不为空,它将返回10。类似地,如果Y=5,函数if(Y=5,NULL,3*Y)将返回一个空缺(NULL)值

 

介绍了一种新的双向方差分析的多重比较方法:比较仅相差一个因子的细胞的平均值。在行和列内同时执行多个比较,同时更正适当的比较总数

 

增加了在双向方差分析后进行多重比较时选择特定比较的能力

 

极大地扩展了使用“分析常数/挂钩常数”对话框可以挂钩的分析常数(结果)的数量

 

更新了“变换”对话框中函数的命名(以及其他相关分析)。为了保持一致性,所有函数现在都是小写(例如,我们现在在“转换”对话框中使用“日志”而不是“日志”)

 

添加了一个新的响应P值摘要样式:“一个或无”。对于这种样式,任意低于指定阿尔法阈值的P值都将被分配一个星号,而所有其他P值将被分配“ns”(在使用FDR校正方法的情况下为“nd”)。如果alpha发生更改,这些P值摘要分配将自动更新

 

当使用比较校正的FDR方法时,更新了成对比较的行为。在这种情况下,将始终使用新的“一个或无”P值样式,并且浮动注释将解释添加的星号的解释。此外,摘要“nd”用于表示“未发现”

 

介绍了在使用提取和重排分析创建XY表时定义主题/复制变量的能力。所选变量的值将成为创建的表的子列标题

 

改进了当使用“总分数”分析且存在空缺(排除)行或列时显示的浮动注释的措辞

 

非数学

 

将可添加到每个数据表的数据列数增加一倍(从以前版本的Prism中的1024列增加到Prism 10中的2048列)

 

删除了对可以同时打开的文档数量的限制(以前版本的限制为16

 

在“选择和变换”对话框中添加了“全选”和“取消全选”指令

 

添加了上下文菜单指令,用于在多变量图上按大小或颜色选择数据点

 

更新了多变量图形上颜色分配的行为,以便图形的颜色范围基于源数据表中的数据范围,而不是图形上显示的数据

 

介绍了使用“双击”方法根据大小或颜色选择数据组的能力

 

更新了多个变量图形图例的行为,使其范围基于源数据表中的数据范围,而不是图形上显示的数据

 

更新了带有负数的轴前缀的行为,使其出现在负数和值之间(而不是出现在负数之前)

 

为.pzf和.pzfx文件实现了“兼容性模式”,允许在Prism 10中无缝访问这些遗留文件格式

 

在检验到公式错误的情况下,改进了Prism公式编辑器中光标放置的行为

 

(Windows)启用从蒙特卡洛结果表调用的“更改”菜单中的“数据分析…”项

 

(Mac)为图形上的“带星号的直线”对象启用主菜单指令“排列”>“位置对象”

 

(Mac)更新了Cmd+Backspace键盘快捷键的行为。在表上且不处于编辑模式时,此快捷方式将清理选定的单元格。在编辑模式下,此键盘快捷键将清理从行开始到当前光标位置的文本。在以前版本的软件中,即使在文本编辑模式下,此快捷方式也可能已清理选定的单元格,这是意外的

 

表现

Prism 10经过优化,在以下情况下比Prism 9更快:

 

保存Prism文件(尤其是包含大量数据的文件)

 

从数据表中导出大范围的数据

 

渲染图形

 

在工作表之间切换

 

导出图形和布局

 

模拟大量数据

 

修正了以前导致错误结果的分析错误

 

修正了使用“变量与值”功能选择行时选择和转换分析的问题,而输入数据包含所选变量的空缺值。在某些情况下,这些空缺行被错误地返回为与选择条件匹配

 

修正了其他与分析相关的Bug

 

修正了“选择并变换”分析,因此如果没有为自定义变换提供标题,Prism将使用参数对话框中下拉菜单中的变换定义。请注意,在为这个新变量生成的(绿色)结果表中不会使用任意标题

 

修正了“删除基线和列数学”分析结果显示极小值而不是“0”的问题

 

修正了在“参考水平”选项卡中为分类变量选择自定义项目后,在多元线性回归参数对话框的“插值”选项卡中意外重置“一级(默认)”项目的问题

 

将结果选项卡的名称从“Mean diff.CI plot”更改为“Geo.Mean of ratio CI plot”,创建时选择了“Graph CI of geometric means of ratio”选项,以进行比率配对t检验

 

修正了“提取并重新排列”分析生成的结果中带有变量的列的顺序,以正确说明负值

 

修正了“多重t检验”分析结果表中用于多重比较的Šídák-Bonferroni方法名称中的拼写错误

 

启用“参数:简单线性回归”对话框中min和max值的“使此选项卡上的选项成为未来拟合的默认选项”

 

(Windows)在“参数:模拟列数据”对话框中为超过256的数据集启用挂钩按钮

 

(Windows)解决了在"表格"中选择不合适的表格的问题。"分析数据"对话框"蒙特卡洛"分析"部分 

 

(Windows)解决了"参数:蒙特卡洛"对话框"参数表"标签分析常树中出现的信任区间标题损坏问题 

 

(Windows)可以在"参数:模拟XY数据"对话框的"参数值和列标题"选项卡中选择超过256个数据集 

 

(Windows)解决了Prism在试图为非线性回归分析创建一个新的方程时会崩溃的问题 

 

解决了"参数:选择和转换"对话框中排除源数据表中一个值时丢失转换定义的问题 

 

解决了"参数:多重逻辑回归"对话框选项卡中在修改"模型"选项卡上的结果值后没有自动更新结果标签的问题

 

在修改了轴范围的min值和max值之后,解决了图表上显示意外值而不是"0"的问题

 

图像错误

 

修正了在画廊视图模式下没有更新图预览的问题 

 

修正了一个问题,即使用"日志10"比例尺的左Y轴编号在布局表中的图表中意外地被剪掉。 

 

将位置对象对话框中的角度输入限制在360度 

 

(窗口)解决了以下问题:如果使用超过1000个单元格生成图形,则将符号在分组的交叉图上剪下 

 

解决了将多个变量图导出到Tif或PNG文件格式时缺少透明度的问题 

 

解决了这样一个问题,即在"单向变异数分析"之后对选定的两列进行对对比较时,没有使用特征转移到新的图中

 

其他Bug已修正

修正了执行“重复族”后数据表会意外链接到新创建的图形的问题

 

修正了多变量数据表中的非拉丁分类值在“提取和重排”分析结果中损坏的问题

 

修正了在XY或分组数据表中两次切割“上限”列的值后,“下限”列的数据消失的问题

 

(Windows)修正了Prism在尝试将布局内容粘贴到重复的图表时会崩溃的问题

 

(Windows)修正了在链接的“整体部分”数据表中添加或删除值为0的行后,Prism在尝试移动饼图上的数据时会崩溃的问题

 

(Windows)修正了Prism在按住数据表中的箭头键时偶尔会崩溃的问题

 

(Windows)修正了“标题”一词意外出现在导出为TXT文件的结果表中的问题

 

(Windows)修正了删除或清理所有值和标题后未从数据表中删除/删除数据集的问题

 

(Windows)修正了如果包含示例数据的文件夹为空,则在“整体的一部分”和“多个变量”选项卡的欢迎对话框中,字符串“教程数据文件丢失。重新安装Prism以恢复它们”出现损坏的问题

 

(Windows)修正了当数据集数量超过100时,“格式化图”对话框的“选择要格式化的数据集”子对话框的组件出现损坏的问题

 

(Windows)修正了当相应表上存在浮动注释时,无法编辑文本或向“设置数据表格式”对话框的“列标题”选项卡上的标题添加特殊字符的问题

 

(Mac)修正了在具有嵌入表的图形上执行撤消指令时Prism会崩溃的问题

 

(Mac)修正了如果源数据被删除,尝试更新链接数据时不会出现警报的问题

 

 

 

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2023-07-12 14:31
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