生物分子质量分析软件ProMass的特点

本文提供多方面信息，涵盖了从自动解卷积、质谱解析到PPL数据处理技术，集成Xcalibur系统的指令，以及利用ZNova算法进行准确和快速的质量确定。适用于生物分子质谱分析，包括蛋白质、肽和寡核苷酸，是实验室技术人员和科研专家的理想指南。

生物分子质量分析软件ProMass具有以下特点：

自动解卷积生物分子质谱以确定分子质量：适用于蛋白质、肽、寡核苷酸等。
与赛默飞世尔科技Xcalibur数据系统集成。
使用专有的ZNova算法进行无伪影解卷积，无需手动干预即可去除伪影峰。
适用于低信噪比（S/N）光谱。
适用于高和低荷质比光谱（例如，适用于肽和蛋白质）。
在解卷积之前自动应用光谱平滑和基线去除。
由Xcalibur处理方法指导的液相色谱/质谱（LC/MS）峰处理。数据可以处理基于N个蕞大色谱峰、所有高于相对强度阈值的峰等。也支持自动背景减除。
可以处理Windows剪贴板上的光谱数据。
自动基于网络的报告，包括总结报告、色谱图（紫外和质谱）、原始和解卷积后的质谱。
自动计算目标寡核苷酸和多肽的预期质量。
彩色编码的结果显示和ProMass浏览器总结报告，用于快速可视化结果，包括集成的样品板查看器。
自动搜索多个目标质量，并以彩色编码的网络总结报告形式显示结果。
可选择性地为所有处理的样品生成基于Excel的总结。
色谱图自动标记了基峰解卷积质量。
电喷雾电离（ESI）光谱自动标记了丰富成分的荷质比。
每个解卷积光谱自动生成峰列表和日志文件，包括有关质量、标准偏差、评分和解卷积参数的信息。
可处理轮廓数据或质心数据。可选择性地为任一数据类型生成质心化输出。
可直接输出到明确指定的文件夹，基于输入文件名、基于日期，或基于获取数据的位置。
包括用于参数设置、序列设置、处理方法验证和ProMass DecView中解卷积光谱的交互式查看的图形用户界面（GUI）。
网络报告可以用您自己的公司logo定制。
ZNova核心算法通过其指令行界面可脚本化，允许您根据需要创建自己的应用程序。

ProMass HR的附加功能：

ProMass HR包括完整的Positive Probability Ltd. (PPL)数据处理包，用于荷质比解卷积、去同位素化和峰形解卷积。
PPL软件包包括用于执行手动数据处理任务的ReView图形界面，这些任务使用PPL算法。ReView也用于构建PPL方法，这些方法可以嵌入ProMass参数文件中，并允许使用PPL算法进行自动化处理。
PPL去同位素化可应用于具有同位素分辨的质谱，用于在仪器的质量准确度下（例如，Orbitrap数据的<3ppm）确定生物分子的准确（单同位素）质量。
PPL峰形解卷积可以与ProMass荷质比解卷积结合，以提高生物分子（例如，单克隆抗体MAb's）质谱的分辨率，然后进行荷质比解卷积。这可以使用低分辨率数据完成。
ProMass HR可以引用包含PPL方法的ProMass参数文件，以自动处理整个来自Xcalibur样品列表的LCMS数据集。