正版软件DNASTAR Lasergene 19.0 发布说明

Lasergene 19.0 在蛋白质、基因组学及转录组学工作流程中带来了多项重要更新。新算法与蛋白质设计力场、集成化注释工具、与 SciNote 电子实验记录本（ELN）的整合、扩展的云端及本地建模支持，以及增强的工作流程可及性，助力用户更快分析数据、更快捷协作并加速科学发现。

主要更新领域

• 蛋白质结构与相互作用
• 变异分析
• 基因组可视化
• 从头基因组组装
• 抗体库分析
• SciNote ELN 集成
• 其他增强功能

蛋白质结构与相互作用

Protean 3D 在结构预测和蛋白质设计方面引入了新的灵活性。

• 通过 Protean 3D 中统一的结构预测向导，设置 Boltz、AlphaFold-Multimer、NovaDock 和 NovaFold Antibody 预测。
• 每个 Lasergene Protein 许可证均包含基于云端的蛋白质建模预测次数，可用于任意类型的建模预测，并可按需购买额外预测次数。
• 在本地运行 Boltz、NovaDock 和 NovaFold Antibody 预测，以获得更高的数据保护能力及无使用限制。
• 使用预测向导，基于共同的固定输入和一系列可变的蛋白质或配体结合分子，轻松配置多个结构预测。
• 在蛋白质设计过程中，从多个 Amber 力场中进行选择。

变异分析

Lasergene Genomics 提供了更快的组装速度和更广泛的工作流程兼容性。

• 组装并分析在 Element 测序平台上生成的数据。
• 经过优化的 SeqMan NGen 组装性能，相比 Lasergene 18.1，处理速度提高可达 2 倍。
• 通过自动化准确性测试和完整的捕获区域性能指标，验证序列组装结果。

基因组可视化

GenVision Pro 引入了带有基因查找功能的新数据轨道。将数据轨道应用于分析视图，可定位以下位点：

• 开放阅读框（ORF）
• 剪接位点
• 转录因子结合位点

从头基因组组装

在 SeqMan NGen 中解锁增强的长读长从头组装性能。

• 通过改进的比对算法，实现更快的序列组装并生成更长的重叠群（contigs）。
• 使用 AUGUSTUS 和 Swiss-Prot 信息自动注释组装结果。
• 通过简化的组装参数选择，优化工作流程设置。

抗体库分析

SeqMan NGen 新增了一个用于单细胞 V(D)J 抗体库分析的测试版转录组学工作流程。该工作流程能够表征 B 细胞克隆型，并允许从 10x Genomics 免疫分析数据中恢复配对的抗体链序列。

• 分析来自人和小鼠 10x Genomics 实验的单细胞 BCR 免疫分析 FASTQ 数据。
• 利用基于条形码的从头组装和集成化的本地 IGBlast 注释，恢复配对的抗体重链和轻链序列。
• 使用 Protean 3D 中的 Boltz 和 NovaFold Antibody 算法，鉴定克隆型、评估序列生产性，并预测抗体结构及抗原结合。

SciNote 电子实验记录本（ELN）集成

SeqBuilder Pro 现已与 SciNote 电子实验记录本（ELN）集成，帮助实验室改善数据组织、协作、可追溯性及合规性。

• 将 SeqBuilder Pro 与任意付费版本的 SciNote ELN 连接。
• 将 SeqBuilder Pro 中的序列、项目、图像、引物设计及虚拟克隆工作流保存并管理到 SciNote。
• 利用 SciNote 的电子签名、审计追踪、自动化报告及 FDA 21 CFR Part 11 合规性等功能，提高数据可追溯性与协作效率。

其他增强功能

Lasergene 19.0 在多个应用程序和软件包中包含一系列新的可用性与可访问性功能：

• 使用 DNASTAR Navigator，利用 AUGUSTUS 和 Swiss-Prot 数据自动注释 FASTA 文件。
• 通过 DNASTAR Navigator 使用 PubMLST 鉴定微生物菌株。
• 在 SeqMan NGen 中，选择 TPM（每千碱基百万转录本）标准化作为 RNA-Seq 组装的选项。
• 在手动输入序列或配置 BLAST 搜索查询时，可语音播报核苷酸和氨基酸残基（适用于多个 Lasergene 应用程序）。