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生态排序分析软件

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一数据排序分析的软件之一            

·生态学多元数据排序分析软件Canoco 5介绍,作者:赖江山        

·生态排序分析软件Canoco 5.1 已正式发布        

·使用Canoco进行多元生态数据分析5 第二版        

Canoco是用于多元数据分析的软件包可视化,强调降维(排序),回归分析,两者结合,任命的约束。Canoco 现在的版本是5.12。Canoco实现是很多排序的新进展,如变分,协对应分析,基于距离的冗余分析和环境关联的双重约束排序,但主要的进步是用户友好性。

 

在Canoco 5中,数据导入、分析和图表制作都在Canoco 5 项目中。Canoco顾问帮助选择数据转换和分析方法。数值以前需要多次运行的分析,现在可以通过单个分析模板和分析笔记本简要地总结了结果,并允许访问的结果。对一组数据表的分析现在在Canoco 5项目中收集,共享分析和绘图设置。Canoco 5 帮助实现更好的发布质量排序图。手册已被大量重写,并更新了大量的显示生活中的例子并扩展到展示处理多元数据的新方法。

 

解释并了解其中的模式和结构性质。目的可以是科学的或技术或两者兼而有之。但是自然可以是混乱大,所以模式和结构,经常从嘈杂的数据集中获得从少数到很多情况和变量。排序方法为Canoco提供的可以帮助科学家从中推断出图案和结构数据集,尤其是以案例和变量之间的关系。数据可能来自现场或实验室,可以是观察性或实验性的。如今,数据集都来自高吞吐量产生DNA概况或表达水平或蛋白质含量的仪器或具有相关因素或样品的代谢物,例如组织类型,实验性处理和采样时间。

 

Canoco 5合了排序以及回归和排列方法学,以便得到的生态数据统计模型。Canoco 5线性和曲线单峰方法。使用Canoco 5进行排序,能够了解:

  • 生物群落的结构

  • 植物与动物群落以及它们的环境之间的联系

  •  对环境和(或)其生物群落的假设冲击所能造成的影响

  • 在生物群落上进行的複杂生态学和生态毒理学实验的相关处理所能造成的影响

 

软件

  • Canoco 5实现了接近在排版方面的进展,例如变化分区,协同对应分析和基于距离的冗余分析,但主要的进展是用户的友好性。在Canoco 5中,数据导入,分析和绘制图形被到Canoco 5项目中。

  • Canoco帮助选择数据转换和分析方法。过去需要多次运行的数值分析,现在可以通过单峰分析模板和分析笔记简洁地总结结果,并允许访问的结果。

  • 对一组数据表示所做的分析现在都在Canoco 5项目中手机,共享分析和绘图设置。Canoco 5有助于制作更好的发布质量排序图。

  • 手册已经被重新编写,大量的现实生活中的粒子被更新和扩展,以展示处理多变量数据的新方法。

 

软件功能

  • 对两组或三组预测者来说,变化划分很实现,根据部分或非部分分析和使用原始或调整的变化估计计算被解释的变化的各个部分。

  • 在变分划分框架中,可以使用邻矩阵主坐标(PCNM)方法。目前的实现符合Legendre&Legendre(2012)中的方法名称(dbMEM)下的建议。

  • 计算、测试和绘制主响应曲线(PRC)现在是一项的任务。

  • 工队应分析(CoCA,对称形式)可用,蒙特卡罗置换测试两种比较群落类型的共变异。

  • 预测器的逐步选择在视觉上得到了增强,现在提供了对I型错误膨胀的保护(用预测器进行初步测试,通过三种方法之一调整P值:错误发现率(FDR)估计、Holm校正和Bonferroin校正)。

  • 可以直接测试约束轴,并将两个培训结果与Procrustes分析进行比较

  • 您可以地处理物种的功能或导入物种的系统发育相关数据,以及计算和使用功能多样性。

  • 可视化功能得到了增强,例如半透明填充色,在纵坐标图中显示变量箭头的校准轴或绘制封闭椭圆以替代封闭多边形。在现有文件格式(PNG、BMP 、EMF、Adobe Illustrator)中添加了JPEG、TIFF和PDF文件格斯的导出类型。

  • 您的工作的每一步都由上下文敏感的帮助系统和Cancona - 系统,帮助您为那您的研究问题Corre选择合适的分析方法。

 

操作系统:

Canoco在Windows 8 、 8.1或10的32位和64位版本的标准台式机和笔记本电脑上都可以正常工作。

Canoco 5也可以在Microsoft操作系统上运行,从安装了(Service Pcak)2或SP3的Microsoft Windows XP开始。这也Windows Vista和Windows 7。

Canoco 5经过测试,可以在Linux上的Wine环境下运行,并且也可以在CrossOver软件包的类似环境中运行。

 

 

 

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