HyperChem - 分子模拟与教学软件
简介:
Hyperchem是一款分子模拟软件。通过3D对量子化学计算,分子力学及动力学进行模拟。Hyperchem为您提供更多的模拟工具: 图形界面,半经验计算方法(AM1,PM3等),UHF,RHF和CI,密度泛函。可进行单点能,几何,分子轨道分析,蒙特卡罗和分子力学计算,预测可见-紫外光谱。
HyperChem的计算方法分子力学、分子动力学和半经验分子轨道方法以及密度泛函理论。HyperChem可以适用于分子性质的计算分析、构象搜索、以及的量子化学计算和分子力学模拟等等。
是你做化学研究还是普通的化学实验,HyperChem都可以帮你无误的分析情况,并且还提供了科学的实验分析环境,可以在环境上分析化学实验的数据,提供了多种设备的端口数据接入。除此之外,HyperChem还可以将化学研究的各项分析数据原子、分子结构加载到里面使用,内置模型库以及绘图工具,方便您自己设计化学分析,并且还有可视化的用户界面,其中图形,模拟工具等,简洁明了,便捷!
功能
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结构输入和对分子操作。
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显示分子。
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化学计算。用量子化学或经典势能曲面方法,进行单点、几何和过渡态寻找计算。可以进行的计算类型有:单点能,几何,计算振动频率得到简正模式,过渡态寻找,分子动力学模拟,Langevin动力学模拟,Metropolis Monte Carlo模拟。的计算方法有:从头计算,半经验方法,分子力学,混合计算等。
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可以用来研究的分子有:同位素的相对,生成热,活化能,原子电荷,HOMO-LUMO能隙,电离势,电子亲和力,偶矩,电子能级,MP2电子相关能,CI激发态能量,过渡态结构和能量,非键相互作用能,UV-VIS吸收谱,IR吸收谱,同位素对振动的影响,对结构的碰撞影响,团簇的。
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用户定制的外部程序。
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模块:RAYTRACE模块,RMS Fit,SEQUENCE编辑器,晶体构造器糖类构造器,构像搜寻,QSAR,脚本编辑器。
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新的力场方法:Amber 2,Amber 3,用于糖类的Amber,Amber 94,Amber 96。
ESR谱。 -
电化率。
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二维和三维势能图。
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蛋白质设计。
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电场。
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梯度的图形显示。
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新增功能:密度泛函理论(DFT)计算,NMR模拟,数据库,Charmm蛋白质模拟,半经验方法TNDO,磁场中分子计算,激发态几何,MP2相关结构,新的芳香环图,交互式参数控制,增强的聚合物构造功能,新增基组。
HyperChem软件:
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使用鼠标选择,旋转,转换和调整分析结构大小
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使用HyperChem Model Builder将基本草图转换为3D结构
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定义原子类型,原子质量等的可能性
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能够添加元素附加化学表
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能够以Brookhaven PDB,ChemDraw CHM,MOPAC Z矩阵,MDL MOL,ISIS Sketch和Tripos MOL2文件的标准格式导入结构。
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查看分子结构作为木包装的颗粒
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可以增加风帆冲浪点
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在工作空间中显示自定义图像
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设置和显示原子的自定义标签
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能量追踪在内的计算
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分子动力学模拟
HyperChem 8.0版新增功能:
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兼容Microsoft Vista
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第三方软件接口。执行GAMESS,PQS,MOPAC2007,WinGamess,PC-Gamess,Q-Chem,Gaussian等的计算,产生 输入文件,读取输出用于显示轨道,光谱等,接口是开源的,可以对其进行扩充,接到用户自己的代码中。
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批处理功能
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数值都改为双精度
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Undo和Redo,Draw和Undraw选项;4个文件列表
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结构测量功能;化学取代功能
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熵和自由能;任意温度的热容;零点能;速率常数;平衡常数
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MP2增加了新功能,能做SCF的地方,就能研究后-Hartree-Fock结果
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CI从单点计算菜单中分出来,使用更和方便
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温度作为全局变量,可用于分子动力学,蒙特卡罗等
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计算光谱的线宽
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MM-QM更清晰的定义量子区和经典区
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MD计算中可以固定原子
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分子力学计算加入电场
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分子的3D显示
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对量子力学和分子力学计算进行振动分子
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箱中粒子,用于教学
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多种单位系统:kcal/mol,kj/mol,a.u
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新的半经验方法RM1。RM1方法是重新参数化的AM1,结果优于AM1和PM3,的元素有H,C,N,O,P,S,F,Cl,Br,和I
英文介绍:
HyperChem unites 3D visualisation and animation with quantum chemical calculations, molecular mechanics and dynamics, putting more molecular modeling tools at your fingertips than any other Windows program.
HyperChem is a sophisticated molecular modeling environment that is known for its quality, flexibility, and ease of use. Uniting 3D visualization and animation with quantum chemical calculations, molecular mechanics, and dynamics, HyperChem puts more molecular modeling tools at your fingertips than any other Windows program.
Our newest version, HyperChem Release 8.0, is a full 32-bit application, developed for the Windows 95, 98, NT, ME, 2000, XP, and Vista operating systems. HyperChem Release 8.0 incorporates even more powerful computational chemistry tools than ever before, as well as supporting multiple third-party applications. Its drawing and rendering capabilities and ease of use are standards for the industry.
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